Forschung

Aktuelles:

• Zum 01. Februar 2011 werde ich nach Wageningen/NL in die Gruppe von Paul van den Brink wechseln. Im MarieCurie-Netzwerkprogramm CREAM geht es um die mechanistische Modellierung ökologischer Effekte von Chemikalien in der Umwelt, vor allem in Fliessgewässern.

Veröffentlichungen:

1. Focks, A. (2005):
   Modeling the transfer of antibiotic drug resistance genes (Diplomarbeit).
   Beiträge des Instituts für Umweltsystemforschung (Hrsg. M. Matthies), Nr. 29, ISSN-Nr. 1433-3805.


2. Heuer, H., Focks, A., Lamshöft, M., Smalla, K., Matthies, M., Spiteller, M.:
   Fate of sulfadiazine administered to pigs and its quantitative effect on the dynamics of bacterial resistance genes in manure and soil.
   Soil Biology & Biochemistry 40, 1892-1900 (2008)


3. Schauss K., Focks A., Leininger S., Kotzerke A., Heuer H., Thiele-Bruhn S., Sharma S., Wilke B. M., Matthies M., Smalla K., Munch J. C., Amelung W., Kaupenjohann M., Schleper C., Schloter M.:
   Dynamics and functional relevance of ammonia-oxidizing archaea in agricultural soils.
   Environmental Microbiology 11(2), 446-456 (2009)


4. Schauss K., Focks A., Heuer H., Kotzerke A., Schmitt H., Thiele-Bruhn S., Smalla K., Wilke BM., Matthies M., Amelung W., Klasmeier J., Schloter M.:
   Analysis, fate and effects of antibiotic sulfadiazine in soil ecosystems
   Trends in analytical chemistry 28(5), 612-618 (2009)


5. Focks A.:
   Effects of Sulfadiazine in Soil: Integrative Modelling Approaches as a Basis for Environmental Risk Assessment
   Dissertation erschienen im Dr.Hut-Verlag (München), ISBN 978-3-86853-041-4 (2009)


6. Focks A., Klasmeier J., Matthies M.:
   The mechanistic link between sulfonamide uptake and effect on the growth of bacteria: Model development and application to experimental data from two soil microorganisms
   Environmental Toxicology and Chemistry 29(7), 1445-1452 (2010)


7. Zheng C., Focks A., Ellebrake K., Eggers T:, Fries E.:
   Sorption of Ortho-Phenylphenol in Soils
   CLEAN - Soil, Air, Water in press


8. Focks A., Seitter M., Lamshoeft M., Lehmann S., Klasmeier, J., Hertel C., Matthies M.:
   In vitro testing of the antimicrobial activity of sulfadiazine metabolites
   in preparation.
   

Vorträge

1. Modellierung der Übertragung von Antibiotikaresistenzgenen zwischen E.coli-Stämmen.
   Vortrag im Rahmen des Forschungsseminars Systemwissenschaft, USF Osnabrück, 26.01.2005
2. Transfer von Resistenzgenen
   Vortrag im Rahmen der Vorlesung "Umweltrisikoanalyse" am USF in Osnabrück, 28.06.2005 [zip(4.4 MB)]
   
3. Übertragung von Plasmid-lokalisierten Antibiotikaresistenzgenen zwischen E.coli-Stämmen im Boden.
   10. Jahrestagung der SETAC GLB, Basel, 28.09.2005 [pdf (439 KB)]
4. Model-based analysis of the influence of nourseothricin on the transfer of nourseothricin resistance between E.coli in soil microcosms.
   Informeller Workshop Veterinärantibiotika in der Umwelt, RIVM Bilthoven, 06.02.2006.
5. Speziierung von Sulfonamiden: Wirkung auf die Folsäuresynthese in Bakterienzellen
   11. Jahrestagung der SETAC GLB, Landau, 05.09.2006
6. Modelling the effect of manure from sulfadiazine-treated pigs on soil microorganisms.
   Forschungsseminar Systemwissenschaft, USF Osnabrück, 17.01.2007
7. Modelling the effect of sulfadiazine on soil microorganisms: functional biomass .
   Informeller Workshop "Antibiotika in der Umwelt", Universität Trier. 22. März 2007
8. Modelling the effect of manure and sulfadiazine on ammonium-oxidizing bacteria in soil .
   DFG-Forschergruppen-Workshop, TU Berlin. 10. Mai 2007
9. Ein Modell zur Beschreibung von Stickstoffumsatzprozessen im Boden und deren Hemmung durch Sulfonamide
   Jahrestagung der GDCh-FG Umweltchemie und Ökotoxikologie, Osnabrück, 26.09.2007
10. Ein Modell zur Beschreibung von N-Umsatzprozessen im Boden und deren Hemmung durch Sulfonamide.
    Seminar der Abteilung für Terrestrische Ökogenetik, Institut für Bodenökologie, Helmholtz Zentrum München, 23.10.2007
11. Häufigkeit von Sulfonamid-Resistenzgenen in Gülle und Boden unter dem Einfluss von Sulfadiazin: Anwendung eines einfachen mathematischen Modells.
    Forschungsseminar Systemwissenschaft, Osnabrück, 14.11.2007
12. Modelling the effects of manure and sulfadiazine on ammonium-oxidizing micro-organisms in soil .
    Seminar der Abteilung Umweltchemie, Eawag, Zürich, 16.01.2008.
13. Sulfadiazin in Ackerböden - Mechanismen und Modellierung der Wirkung auf Umweltmikroorganismen.
    3. Gemeinsame Tagung von SETAC GLB und GDCh, Frankfurt am Main 24.09.2008.
14. Sulfadiazine in soils - Mechanisms and Modelling of Effects on Environmental Microorganisms.
    Workshop on Fate and Effects of Pharmaceuticals in Soil, Bonn, 02.10.2008.
15. Metropolis - ein Algorithmus zur stochastischen Parameteroptimierung von DGL-Systemen.
    Forschungsseminar Systemwissenschaft, USF Osnabrück, 13.05.2009
16. Untersuchung des bakteriostatischen Effektes von 4-Hydroxy-Sulfadiazin
    Jahrestagung der GdCh-Fachgruppe Umweltchemie und Ökotoxikologie in Trier, 23.-25.09.2009
17. Experimentelle und modellierte Konzentrationsdynamik des Biozids Irgarol® in einem Wasser-Sediment Mesokosmos-Versuch
    Jahrestagung der SETAC-GLB in Weihenstephan, 05.-07.10.2009
18. Modelling soil nitrification considering the dynamics of functional biomass.
    Seminar des Instituts für Umweltforschung, RWTH Aachen, Aachen, 10.11.2009
19. Untersuchungen zu Verbleib und Effekten von zwei Tierarzneimitteln im Boden.
    Kolloqium des Fachgebietes Standortkunde und Bodenschutz, Institut für Ökologie, TU Berlin, 04.05.2010

Poster

1. Focks,A.; Matthies,M.; Pukall,R; Smalla,K.:
   Transfer of plasmid-located nourseothricin resistance genes between E.coli strains in soil microcosms: A model approach to analyze experimental data.
   SETAC Europe, The Hague, 07.-11.05.2006. [pdf (140KB) ]
2. Focks,A.; Matthies,M.; Klasmeier,J.
   Influence of Sample Number on Statistical Estimation of Microhabitat Dispersion Parameters in Soil
   11th International Symposium on Microbial Ecology, Vienna, 20.-25.08.2006 [pdf (485KB) ]
3. Focks, A., Kotzerke, A., Schauss, K., Schloter, M., Matthies, M.: Mikrobielle Konkurrenz unter der Wirkung von Sulfadiazin: Modellierung des Effektes eines Veterinärantibiotikums auf Ammonium-Oxidierer im Boden
   12. Jahrestagung der SETAC-GLB, Halle-Leipzig, 12.-14.09.2007 [pdf (283KB) ]
4. Focks,A.; Matthies,M.; Klasmeier,J.
   Mechanistic modelling of the effect of the antibiotic sulfadiazine on nitrification in agricultural soils
   19th annual meeting of SETAC Europe, Göteborg, 31.05. - 04.06.2009.
   
5. Meinecke,S.; Focks,A.; Feibecke, M.:
   Dissipation dynamics of chemicals in water-sediment studies: a conceptual model approach and simulations of the fate dynamics of Irgarol® in a mesocosm study as an application
   20th Annual meeting of SETAC Europe, Sevilla23.-27.05.2010
6. Focks,A.;Seitter,M.;Lamshöft,M.;Klasmeier,J.;Matthies,M:
   Effectiveness of environmentally relevant sulfadiazine metabolites on the growth of E.coli tested by in vitro tests
   20th Annual meeting of SETAC Europe, Sevilla23.-27.05.2010
7. EF Fries, C Zheng, K Ellerbrake, T Eggers, A Focks:
   Adsorption of orthophenylphenol to soil
   20th Annual meeting of SETAC Europe, Sevilla, 23.-27.05.2010
8. S Meinecke, M Feibicke, W Mailahn, D Hennecke, A Focks:
   Experimental and modeled degradationand distribution of Metilox in a pond mesocosm system
   20th Annual meeting of SETAC Europe, Sevilla23.-27.05.2010